二世达赖喇嘛根敦嘉措(1475—1542年) ,意为“僧海”,后藏达纳人。1478年被认定为一世达赖的转世灵童,11岁入扎什伦布寺,受沙弥戒。20岁时前往哲蚌寺学习。其后10余年在前、后藏、山南等地云游,讲经传法,聚集一批弟子,声名大震。公元1509年,创建山南却科杰寺。次年受扎什伦布寺僧人迎请,出任第五任法台(住持)。后又返回哲蚌寺,应僧众请求担任哲蚌寺法台。1526年兼任色拉寺第九任法台。在哲蚌寺内修建甘丹颇章(寝宫)大殿。自此以后,历代达赖喇嘛按惯例均担任哲蚌寺和色拉寺法台。
根敦嘉措的著作有《二十一度母广说》、《根噶嘉参大师传》、《上师赞颂集》、《佛菩提颂》、《教言道情歌集》、《密集生起次第》、《中观注疏·义明》、《宗派论·海之舟》、《书札诗歌》、《噶当经典摄义》、《自传》等44卷。
1542年(明嘉靖二十一年),在哲蚌寺圆寂,时年67岁,其银质灵塔建于哲蚌寺内。后被追认为第二世达赖喇嘛。